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南苏丹有12所大学，以下是南苏丹大学名录，排名不分先后。
1.朱巴大学
2.伦贝克大学
3.托里大学
4.南苏丹天主教大学
5.加兰纪念科技大学
6.西赤道大学
7.北加尔哈尔大学
8.阿科博遗产和纪念大学
9.耶伊农业机械大学
10.圣玛丽学院
11.上尼罗大学
12.加扎勒河大学
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