几年来，楚雄医药高等专科学校根据需求调整专业设置、建立“实习-就业”通道、强化人才培养质量、不断打造学生的就业竞争力、不断拓宽就业渠道，近年的毕业生就业率都保持在98%以上，毕业生专业对口率都在90%以上。用人单位对我校毕业生都非常满意。
学生毕业后主要到涉医药卫生单位就业，这部分学生占90%以上，另有10%左右的学生通过参加普通专升本继续升学读本科，其余的学生选择自主创业或自由职业。
学校为帮助学生实现升学（提高学历）的愿望，除在课余针对在校生开办专升本课程班外，还组织报名参加普通专升本入学考试的应届毕业生举办考前辅导班。今年通过普通专升本入学考试，取得进入本科院校继续学习的毕业生占毕业生总数的10%以上。
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